Lívio, obrigado pela contribuição e esse é um "problema" conhecido e documentado no seguinte KB, apesar do seu post ser bem mais abrangente na solução: ESXi/ESX hosts with visibility to RDM LUNs being used by MSCS nodes with RDMs may take a long time to start or during LU…
Um detalhe importante, é que esse problema ocorre na existência de RDMs que são utilizados nas máquinas virtuais com a funcionalidade do Microsoft Cluster Service (o atual Windows Server Failover Clustering), pois como o mesmo cria reservas SCSI ativas no disco, isso acaba atrasando o processo de boot. Caso tenha RDM e não use MSCS (WSFC), esse problema "teoricamente" não existe.
Mais detalhe sobre esse problema é descrito aqui: ESXi Slow Boot with MSCS - VMware vSphere Blog