おはようございます。
>「再起動時に」とあるので 起動手順「２．」のメンテナンスモード解除した後のあたりでしょうか？
そうです。
今回は、起動手順の２で解除しようとしたところ、#1～#3に同じ仮想マシンが存在していました。
起動手順の４でvCenter Serverから確認したところ、#2、#3からは消えており、#1に移動していました。（本来#2で動作する仮想マシン）
そのほか、アラームで「フェイルオーバーに失敗しました」とか仮想マシンの質問「Copy?Move?」が表示された記憶があります。
既に手元にない環境なので確認は難しい状況ですが、手順は間違っていなさそうなので
ひとまずは安心しております。